Le bois pétrifié est un type de fossile, où la matière organique a plus ou moins été remplacée par des minéraux. Il s'agit du bois de très vieux arbres, qui, pendant des millions d'années, a été remplacé par des silicates (le plus souvent) : opale, quartz, calcédoine. D'autres minéraux peuvent être présents de manière secondaire, comme la limonite, l'hématite, la pyrite, l'oxyde de manganèse, et parfois même la célestine. Ces minéraux influencent la couleur du bois pétrifié. Le processus de pétrification permet de conserver, parfois très bien, la structure de l'arbre, par exemple, les anneaux de croissance ou la structure des feuilles. Parfois, l'état de conservation est tel, qu'il permet d'identifier jusqu'à l'espèce de l'arbre.